Управление школой осуществляется в соответствии с законом Российской Федерации «Об образовании в Российской Федерации» и Уставом школы на принципах демократичности, открытости, приоритета общечеловеческих ценностей, охраны жизни и здоровья человека, свободного развития личности.

​Структура школой позволяет эффективно решать задачи функционирования и развития образовательного учреждения. В школе сложилась следующая система управления:

Директор школы осуществляет управление на принципах единоначалия, который осуществляет текущее руководство деятельностью учреждения, самостоятельного решает вопросы в пределах своей компетенции.В школе формируются коллегиальные органы управления, к которым относятся общее собрание работников учреждения, педагогический совет, а также коллегиальный орган государственно-общественного управления – Совет Учреждения.

​Совет Учреждения  является коллегиальным органом государственно-общественного управления учреждением. Совет Учреждения – это коллегиальный орган государственно-общественного управления школой, призванный решать в первую очередь задачи стратегического управления школой: в каких направлениях развивать школу, чтобы ее сделать успешной и др. С другой стороны, это площадка согласования интересов всех участников образовательного процесса, поиска компромиссных решений по сложным вопросам жизни школы. Состав Совета формируется из представителей работников учреждения, родителей (законных представителей) несовершеннолетних учащихся, представителей местной общественности. В состав Совета входят директор, представитель учредителя, родители (законные представители) учащихся. К компетенции Совета Учреждения относится: определение стратегии развития учреждения; учёт мнений об основной образовательной программе учреждения; рассмотрение ежегодного Публичного доклада и результатов самообследования; согласование кандидатур из числа педагогических работников и учащихся для участия в конкурсах федерального и регионального уровней в соответствии с требованиями, установленными законодательством Российской Федерации и ЯНАО; установление требований к внешнему виду учащихся; рассмотрение и учёт мнения родителей (законных представителей) учащихся по вопросам управления учреждением при принятии локальных нормативных актов, затрагивающих  права и законные интересы учащихся.

Общее собрание работников является коллегиальным органом управления учреждением. Состав общего собрания формируется из всех работников учреждения. Председатель общего собрания избирается простым большинством голосов. К компетенции общего собрания относится: рассмотрение проекта коллективного договора; рассмотрение проекта программы развития учреждения; рассмотрение вопросов об охране и укреплении здоровья, организации питания обучающихся и работников учреждения; рассмотрение ежегодного отчета о поступлении и расходовании финансовых и материальных средств, а также проекта отчета о результатах самообследования; рассмотрение обращений обучающихся, родителей (законных представителей) несовершеннолетних обучающихся о применении к работникам учреждения, нарушающим и (или) ущемляющим права обучающихся, родителей (законных представителей) несовершеннолетних обучающихся, дисциплинарных взысканий; определение перечня и порядка предоставления работникам учреждения социальных льгот из фондов трудового коллектива.

​Важными органами самоуправления школы традиционно являются Педагогический совет, на котором обсуждаются основные вопросы образовательной деятельности школы и общее собрание трудового коллектива, принимающее решения о функционировании учреждения. Оперативные задач деятельности школы  решают   Научно-методический совет, Совет профилактики, а также комиссии (по доплатам и надбавкам).